課程資訊
課程名稱
生醫資料探勘
BIOMEDICAL DATA MINING 
開課學期
95-2 
授課對象
生物資源暨農學院  生物產業機電工程學研究所  
授課教師
陳倩瑜 
課號
BME5419 
課程識別碼
631 U9470 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三2,3,4(9:10~12:10) 
上課地點
知203 
備註
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/952BioDM 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

此一課程在於介紹資料探勘之演算
法應用於生醫相關之研究 

課程目標
使學生獲得從事生醫資料分析必須
之基礎能力 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週一 12:00~13:00
每週三 12:00~13:00 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
30% 
 
2. 
期末專題 
20% 
 
3. 
隨堂報告 
20% 
 
4. 
作業 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/28  國定假日 
第2週
3/07  Introduction 
第3週
3/14  Data Preprocessing 
第4週
3/21  Molecular Classification of Cancer: Class Discovery and Class Prediction by Gene Expression Monitoring 
第5週
3/28  Systems Biology and Bioinformatics Symposium and Workshop (台灣大學凝態科學研究中心 國際會議廳) 
第6週
4/04  Cluster analysis and display of genome-wide expression patterns 
第7週
4/11  Data classification 
第8週
4/18  Protein Secondary Structure Prediction Based on Position-specific Scoring Matrices 
第9週
4/25  Midterm 
第10週
5/02  Detecting subtle sequence signals: a Gibbs sampling strategy for multiple alignment  
第11週
5/09  PROSITE: A documented database using patterns and profiles as motif descriptors [Introduction to EM algorithm] 
第12週
5/16  Discovering motif pairs at interaction sites from protein sequences on a proteome-wide scale 
第13週
5/23  Evolutionary preductions of binding surfaces and interactions 
第14週
5/30  Statistical methods for identifying yeast cell cycle transcription factors 
第15週
6/06  Proposal for final project 
第16週
6/13  Dynamic modeling of cis-regulatory circuits and gene expression prediction via cross-gene identification (10:00上課) 
第17週
6/20  Predicting Gene Expression from Sequence (10:00上課) 
第18週
6/27  Final project demo